高企申报工作是一个需经长期规划、筹备，保持各部门之间、企业与辅导机构之间有效沟通，是量到质变的过程，不是简单的材料整理编写汇总。不仅需要一名专业负责的申报人员，还需行政、财务、技术等各部门之间相配合申报团队。
高企研发费用比例难以达到：很多企业人员对高企研发费用比例要求望而生畏。其实高企认定的研发费用归集范围比较广，即包括了直接研发发生的支出，也包括了间接支持研发发生的费用；而新的认定规定研发费用比例也降低了，所以企业人员可以咨询审计机构正确合理的归集研发费用，核算时应注意与研发费加计扣 除、会计规定归集的范围进行区分。
只有达到条件才考虑申请高企：有些企业人员认为目前达不到高企申报条件，等都具备了再申请认定高企。其实这是错误的想法，企业可以先申请相对高企申报要求较低的高新技术企业培育入库，在培育期间，加大研发费用投入，加快技术研发进度，享受培育入库补贴的同时还可以接受主管部门支持、孵化准备，有助于提高后期认定高新技术企业的成功几率。
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