根据《认定管理办法》的规定，被取消高新技术企业资格的企业，认定机构在5年内不再受理该企业的认定申请。对于盈利能力较强的科技企业而言,5年内不得申请国家高新技术企业认定是一笔巨大的经济损失，因而5年内不得申请国家高新技术企业认定亦是企业需要高度关注的风险之一。
企业的高新资格被撤销，以前年度享受的高新税收优惠都会被税务机关后续如数追回，此外还需缴纳相应的滞纳金。
通常而言，企业累计享受的税收优惠数额加上每日万分之五的滞纳金，将是一笔非常可观的数目。
因此，高新资格的后续维持对企业的持续经营而言至关重要，一旦企业的高新资格被撤销，将面临着后续在指定期限内补缴高额税款和滞纳金的风险。
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